Las posibilidades a nivel jugable que ofrecía el nuevo New Super Mario Bros.Wii eran realmente muy atractivas para los usuarios de Wii, sin embargo, Nintendo ha decidido limitar la capacidad del nuevo videojuego anunciando que no contará con un modo cooperativo a nivel online. Así pues, el título permitirá únicamente la interacción de 4 jugadores a nivel local debido a que "este proyecto utiliza todo el poder de procesado de la Wii", según ha confirmado el propio Shigeru Miyamoto.
New Super Mario Bros.Wii retoma el clásico concepto plataformero en 2D utilizado durante las primeras entregas de la serie, combinados con ciertas imágenes en 3D, originando un nuevo concepto de juego que ya muchas han bautizado como 2.5D.